RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-218	ENST00000557695	PYCR3	Q53H96	274 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TMEM215	Q68D42	235 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	METTL26	Q96S19	204 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	LRRC19	Q9H756	370 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		0.96	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	WRB	O00258	174 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GYG2	O15488	501 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PDYN	P01213	254 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TTMP	Q5BVD1	217 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	NT5C	Q8TCD5	201 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	YPEL4	Q96NS1	127 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2D2	Q9H210	308 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	NSD2	O96028	1365 aa		0.95	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695		A6NED7	52 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2AT4	A6NND4	320 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR5AL1	P0C617	328 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GTF2F2	P13984	249 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GABRR2	P28476	465 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	MAGEA1	P43355	309 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CASP8	Q14790	479 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	COMMD1	Q8N668	190 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2M3	Q8NG83	312 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	MAL2	Q969L2	176 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	RILP	Q96NA2	401 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PORCN	Q9H237	461 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	C6orf50	Q9HD87	102 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GBF1	Q92538	1859 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	COL4A2	P08572	1712 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	KNCN	A6PVL3	124 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	C17orf98	A8MV24	154 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PSMB9	P28065	219 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	HTR2C	P28335	458 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PRDX4	Q13162	271 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SPIN4	Q56A73	249 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	DDIT4	Q9NX09	232 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CFL2	Q9Y281	166 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TMEM131	Q92545	1883 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TRAPPC6A	O75865	159 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TAC1	P20366	129 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	PMCH	P20382	165 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	MLIP	Q5VWP3	458 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GLYAT	Q6IB77	296 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ZNF773	Q6PK81	442 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	SCX	Q7RTU7	201 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2M4	Q96R27	311 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	B9D2	Q9BPU9	175 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	COA1	Q9GZY4	146 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	LAMB2	P55268	1798 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	COL4A1	P02462	1669 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	CD300LB	A8K4G0	201 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	RAB36	O95755	333 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GABRA1	P14867	456 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	GAL	P22466	123 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	P2RY2	P41231	377 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695		Q499Y3	187 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HECTD1-218	ENST00000557695	IDNK	Q5T6J7	187 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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