RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 OR1S1Q8NH92 325 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LIPHQ8WWY8 451 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SDHDO14521 159 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 GNG3P63215 75 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LRP11Q86VZ4 500 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM126AQ9H061 195 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A5P29400 1685 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 G6PCP35575 357 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RGNQ15493 299 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR8G5Q8NG78 346 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FAM222BQ8WU58 562 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5SQ99766 215 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 J3QW42 95 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CD74P04233 296 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB5P28074 263 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR11H1Q8NG94 326 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR11H2Q8NH07 326 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 UPRTQ96BW1 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 WDR34Q96EX3 536 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPB8 328 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 CCL21O00585 134 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OPN1SWP03999 348 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CHRM2P08172 466 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HOXC5Q00444 222 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C1QL4Q86Z23 238 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 NUBPLQ8TB37 319 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DIRC2Q96SL1 478 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF724A8MTY0 619 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 H3BMH7 237 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FCMRO60667 390 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 RAB6CQ53S08 254 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR4A16Q8NH70 328 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR4S2Q8NH73 311 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SIRPB1O00241 398 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACOT8O14734 319 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR2J3O76001 311 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CRYGCP07315 174 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 UMODP07911 640 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LAMP1P11279 417 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF17P17021 662 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACKR3P25106 362 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SRD5A2P31213 254 aa5.6□□□□□ -1.51
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