RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1W2PPB8	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1W2PRS3	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL2L11	O43521	198 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCD6	O75340	191 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RAD51D	O75771	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNA21	P01568	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	PMP2	P02689	132 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	PDGFA	P04085	211 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CRH	P06850	196 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	B4GALT1	P15291	398 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	KLK2	P20151	261 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA2	P20848	420 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	P2RX3	P56373	397 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	STOML3	Q8TAV4	291 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	BANF2	Q9H503	90 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	HTR3B	O95264	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	DIRAS3	O95661	229 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNA2	P01563	188 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RLN2	P04090	185 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	DBH	P09172	617 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SELE	P16581	610 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	AKR1C4	P17516	323 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	VAMP1	P23763	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CHAT	P28329	748 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	GLP1R	P43220	463 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	STAR	P49675	285 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	MEOX1	P50221	254 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SORD	Q00796	357 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52W1	Q6IF63	320 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442		Q8IYB0	196 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	RELT	Q969Z4	430 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-223	ENST00000550442	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.21	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	APC	P25054	2843 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442		E9PLN8	166 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	IGHG3	P01860	377 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	ACKR3	P25106	362 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	SSTR2	P30874	369 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	NTF4	P34130	210 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	APLNR	P35414	380 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-223	ENST00000550442	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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