RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SGCZQ96LD1 299 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RSG1Q9BU20 258 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF576Q9H609 170 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GWJ7 208 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 GOSR1O95249 250 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ATF1P18846 271 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CAPZBP47756 277 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 AMTP48728 403 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TNFSF10P50591 281 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 AUP1Q9Y679 476 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ARPC3O15145 178 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC2A10O95528 541 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 IGHV4-34P06331 123 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LIPFP07098 398 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 PCBD1P61457 104 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CLN3Q13286 438 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 BLNKQ8WV28 456 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35A4Q96G79 324 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SDF2Q99470 211 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OGG1O15527 345 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FAM78BQ5VT40 261 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 OR1P1Q8NH06 330 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DGAT2Q96PD7 388 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 SFT2D2O95562 160 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 RUNX2Q13950 521 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A18Q96N87 628 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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