RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536723.5

USP30-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 30, humanhuman

TSL 5

Gene USP30, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30-209ENST00000536723 GPR50Q13585 617 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 HES1Q14469 280 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 UTF1Q5T230 341 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 GLYATQ6IB77 296 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RNF152Q8N8N0 203 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 TEAD3Q99594 435 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 FAM206AQ9NX38 181 aa14.56□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 PSPNO60542 156 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 IGLV3-1P01715 115 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 SEMG1P04279 462 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 TMEM11P17152 192 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 MYF6P23409 242 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 GABRR1P24046 479 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ESRRGP62508 458 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 IL24Q13007 206 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ZNF429Q86V71 674 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.55□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 AP4M1O00189 453 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 SELENOFO60613 162 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 IFNGP01579 166 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ELANEP08246 267 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 PRRX1P54821 245 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 TMEM42Q69YG0 159 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 OR2T33Q8NG76 320 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 OTULINQ96BN8 352 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 PKIBQ9C010 78 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.54□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ACOD1A6NK06 481 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 INMTO95050 263 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 HAND1O96004 215 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 GASTP01350 101 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 ZNF3P17036 446 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 P2RX3P56373 397 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 RPEQ96AT9 228 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 PYURFQ96I23 114 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 CEP19Q96LK0 163 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 GON7Q9BXV9 100 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.53□□□□□ -0.08
USP30-209ENST00000536723 A6NIN4 97 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 DLGAP1O14490 977 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 MGST3O14880 152 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 DHRS3O75911 302 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SOX14O95416 240 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 GPR12P47775 334 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 RNF148Q8N7C7 305 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 TOMM40LQ969M1 308 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SLAMF9Q96A28 289 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 CMC2Q9NRP2 79 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 U3KQV3 271 aa14.52□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 A0A087X0M5 115 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 A0A1B0GX30 115 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 A0A1W2PPI3 338 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 DUSP1P28562 367 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.5□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 SAP30O75446 220 aa14.5□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 IGKV1D-33P01593 117 aa14.5□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 IGKV1-33P01594 117 aa14.5□□□□□ -0.09
USP30-209ENST00000536723 OR8U8P0C7N1 319 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms