RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	GABRP	O00591	440 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TP53I11	O14683	189 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PHOX2A	O14813	284 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RNF13	O43567	381 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CDRT1	O95170	752 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	AHSA1	O95433	338 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SYNGR4	O95473	234 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	IGHM	P01871	453 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF19	P17023	458 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	F8A1	P23610	371 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GRPR	P30550	384 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PYCR1	P32322	319 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TGM4	P49221	684 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R43	P59537	309 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	INSL4	Q14641	139 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TRAM1	Q15629	374 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC58	Q4VC31	144 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MEST	Q5EB52	335 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LEG1	Q6P5S2	330 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FNDC8	Q8TC99	324 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CT55	Q8WUE5	264 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GHSR	Q92847	366 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PELI1	Q96FA3	418 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TBX5	Q99593	518 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TPK1	Q9H3S4	243 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	HCFC1	P51610	2035 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		A0A087WZY1	265 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0A6YYD4	124 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ISPD	A4D126	451 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		A6NIZ1	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	C21orf140	B9A014	251 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	UPK3A	O75631	287 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RHBDL1	O75783	438 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CBR3	O75828	277 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	UPK1B	O75841	260 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	AKR7A3	O95154	331 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINA7	P05543	415 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TACSTD2	P09758	323 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	AHCY	P23526	432 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	S100A5	P33763	92 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ACVR1B	P36896	505 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	EVX1	P49640	407 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SSR4	P51571	173 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	P2RY4	P51582	365 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	BLVRA	P53004	296 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN6	P56747	220 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RAP1B	P61224	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ACTA2	P62736	377 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RAP1A	P62834	184 aa		3.84	□□□□□ -1.79

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