RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	RRM2	P31350	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TGFBR2	P37173	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PLTP	P55058	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	FGF12	P61328	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	BTG1	P62324	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	DR1	Q01658	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867		U3KQK5	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	P2RY10	O00398	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	NXPH2	O95156	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	FCER2	P06734	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF43	P17038	809 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	HPCAL1	P37235	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	AQP5	P55064	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RBBP4	Q09028	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	FUT5	Q11128	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	HNF4G	Q14541	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	HAGH	Q16775	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MMP28	Q9H239	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	HERC2	O95714	4834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867		A0A096LPI6	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867		H3BQF6	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867		M0R3G1	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RS1	O15537	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MLNR	O43193	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	SCN2B	O60939	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	C6orf47	O95873	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	LAMP1	P11279	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CCL2	P13500	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	IGLL1	P15814	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CXCR1	P25024	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	STOM	P27105	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	S100A5	P33763	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	CFHR2	P36980	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	MPV17	P39210	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	GNB2	P62879	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	GLO1	Q04760	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM1-222	ENST00000531867	BNIP2	Q12982	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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