RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TMED6Q8WW62 240 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SEC22AQ96IW7 307 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RHOFQ9HBH0 211 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 H7C1Q1 480 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 AGPAT2O15120 278 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SYNGR3O43761 229 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 VSIG8P0DPA2 414 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SOX8P57073 446 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 UNC119Q13432 240 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 ZNF345Q14585 488 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RAB35Q15286 201 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 EXO5Q9H790 373 aa7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 A0A0U1RQV5 110 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 MARCH11A6NNE9 402 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 IGLV3-1P01715 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 HOXB5P09067 269 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 HOXA5P20719 270 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 CRYGSP22914 178 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 ATP1B3P54709 279 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PKIAP61925 76 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PSG4Q00888 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PPA1Q15181 289 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 AWAT2Q6E213 333 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TMEM45BQ96B21 275 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 CMBLQ96DG6 245 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SEH1LQ96EE3 360 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RAB22AQ9UL26 194 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TMEM235A6NFC5 223 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RAB27BO00194 218 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 SOX15O60248 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 DHRS3O75911 302 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 LCATP04180 440 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 ARG1P05089 322 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GTF2F2P13984 249 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GLP1RP43220 463 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR3A4PP47883 348 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TNFSF10P50591 281 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 NDUFA6P56556 154 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PRSS12P56730 875 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 QRFPP83859 136 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PMP22Q01453 160 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 AWAT1Q58HT5 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 DRAM2Q6UX65 266 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PRR18Q8N4B5 295 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 CHST4Q8NCG5 386 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR8S1Q8NH09 359 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GPX8Q8TED1 209 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PTX4Q96A99 478 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GPER1Q99527 375 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR10A2Q9H208 303 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 POFUT1Q9H488 388 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SOX6-210ENST00000528252 OR6C6A6NF89 314 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 WIPF3A6NGB9 483 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 TSTD3H0UI37 97 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 EREGO14944 169 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CD3DP04234 171 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 RAB6AP20340 208 aa7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SOX6-210ENST00000528252 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms