RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SHISA5Q8N114 240 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF721Q8TF20 911 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TOMM40LQ969M1 308 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MOB3AQ96BX8 217 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF524Q96C55 264 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PGAM5Q96HS1 289 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SNX22Q96L94 193 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 Q96M66 194 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP5SQ99766 215 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LRFN1Q9P244 771 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 NAT8Q9UHE5 227 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.58□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IGLV3-1P01715 115 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PGA4P0DJD7 388 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PGA5P0DJD9 388 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 BCL2P10415 239 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FCGR2AP12318 317 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 HLA-DOBP13765 273 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PNLIPP16233 465 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB11AP62491 216 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CCL20P78556 96 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 HHEXQ03014 270 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF695Q8IW36 515 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 UEVLDQ8IX04 471 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PRR22Q8IZ63 422 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC35G3Q8N808 338 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SPSB1Q96BD6 273 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 VWCEQ96DN2 955 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CAPNS2Q96L46 248 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM56Q96MV1 263 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 AGMATQ9BSE5 352 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 Q9N2K0 584 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CACNA1CQ13936 2221 aa6.57□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 XKRY2A2RUG3 117 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DDAH2O95865 285 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 COX5BP10606 129 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF17P17021 662 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FUT3P21217 361 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MSX1P28360 303 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 S100GP29377 79 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 RANP62826 216 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MPV17LQ2QL34 196 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 DCAF10Q5QP82 559 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM57BQ71RH2 274 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4X1Q8NH49 305 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 IL22RA2Q969J5 263 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 GABRG3Q99928 467 aa6.56□□□□□ -1.36
HMBOX1-211ENST00000524238 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms