RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PCK2Q16822 640 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE2EQ4V326 116 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MESTQ5EB52 335 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF774Q6NX45 483 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C16orf87Q6PH81 154 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.46□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CALHM1Q8IU99 346 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PARP8Q8N3A8 854 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 YIPF5Q969M3 257 aa3.46□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 CMBLQ96DG6 245 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ASB9Q96DX5 294 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NRBF2Q96F24 287 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 COPS4Q9BT78 406 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR52D1Q9H346 318 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 FN3KQ9H479 309 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 Q9N2K0 584 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MMP26Q9NRE1 261 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TREM2Q9NZC2 230 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 GLS2Q9UI32 602 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ANK2Q01484 3957 aa3.46□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0U1RQV5 110 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf63A6NC05 138 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CD300LBA8K4G0 201 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF879B4DU55 563 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LRRN3E7EW58 273 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SNX3O60493 162 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ATP5HO75947 161 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LY6HO94772 140 aa3.45□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 PAHP00439 452 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 NGFP01138 241 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 THY1P04216 161 aa3.45□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 ANXA8P13928 327 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CTLA4P16410 223 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PTNP21246 168 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A1P30531 599 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 BMXP51813 675 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CRYBA2P53672 197 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LCN2P80188 198 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 IL18R1Q13478 541 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SNAPC1Q16533 368 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 VWC2Q2TAL6 325 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LCN8Q6JVE9 175 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 LEG1Q6P5S2 330 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM29Q86T20 159 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 COMTD1Q86VU5 262 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 DHFR2Q86XF0 187 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C7orf34Q96L11 122 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 Q96M85 177 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf77Q96MU5 243 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 INTS14Q96SY0 518 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 MROQ9BYG7 248 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.45□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 RAB9BQ9NP90 201 aa3.45□□□□□ -1.86
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