RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522556.1

CLK4-211, Transcript of CDC like kinase 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLK4, Length 1,249 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4-211ENST00000522556 KISS1Q15726 138 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 TCF23Q7RTU1 214 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 TNFRSF14Q92956 283 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 OR5M11Q96RB7 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 CHST6Q9GZX3 395 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 NEK6Q9HC98 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLK4-211ENST00000522556 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 A0A1W2PPK0 400 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 GABRPO00591 440 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 PSPNO60542 156 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 KDM4BO94953 1096 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 WNT4P56705 351 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 INSL4Q14641 139 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 PDCD1Q15116 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 HCP5Q6MZN7 132 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 MKXQ8IYA7 352 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR14A2Q96R54 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 HMG20AQ9NP66 347 aa14.64□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 A0A0U1RQK1 487 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 K7N7A8 449 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 ALX3O95076 343 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 RAB3AP20336 220 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR3A4PP47883 348 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SLC35A2P78381 396 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 MED21Q13503 144 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SATL1Q86VE3 508 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SIRPB1O00241 398 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 PIN1P1O15428 100 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TMEM225BP0DP42 221 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CELP19835 753 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 BAMBIQ13145 260 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 EDDM3AQ14507 147 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 IRF3Q14653 427 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CNBD2Q96M20 576 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.62□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR2H2O95918 312 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CYB5AP00167 134 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CHRM2P08172 466 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR3A1P47881 315 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 DLX6P56179 175 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 EDDM3BP56851 147 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 RIPK1Q13546 671 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 ZNF146Q15072 292 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 Q8IYB0 196 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 OR8H2Q8N162 312 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 C17orf50Q8WW18 174 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.61□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TRIM77I1YAP6 450 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 M0R1W7 72 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CDRT1O95170 752 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CD2P06729 351 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 GABRR1P24046 479 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 PAX6P26367 422 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 TAS2R43P59537 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 Q499Y3 187 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 DDI2Q5TDH0 399 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 Q6P435 159 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 JMJD8Q96S16 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 VCX3BQ9H321 246 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 DUSP21Q9H596 190 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.6□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 MELTFP08582 738 aa14.59□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 PRTN3P24158 256 aa14.59□□□□□ -0.07
CLK4-211ENST00000522556 CRHBPP24387 322 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms