RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 ZP1P60852 638 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF273Q14593 569 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 HCP5Q6MZN7 132 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 Q8IYB0 196 aa12.89□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.89□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 GPR148Q8TDV2 347 aa12.89□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 NOX4Q9NPH5 578 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PRD5 423 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PRF3 423 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PRM7 423 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 KDM4BO94953 1096 aa12.88□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 CCL3L1P16619 93 aa12.88□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 KISS1Q15726 138 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 AHSA2Q719I0 299 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR52N4Q8NGI2 321 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 GHSRQ92847 366 aa12.88□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 SMIM19Q96E16 107 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 HMG20AQ9NP66 347 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 FBN3Q75N90 2809 aa12.88□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 PSPNO60542 156 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 HCKP08631 526 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 HKR1P10072 659 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 DLX6P56179 175 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 GUCA2AQ02747 115 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 BLMHQ13867 455 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TCF23Q7RTU1 214 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR8H2Q8N162 312 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM106AQ96A25 262 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 ORAI1Q96D31 301 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 SNX22Q96L94 193 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TNFRSF19Q9NS68 423 aa12.87□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 NPFFO15130 113 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 RAB3AP20336 220 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 UBE2E1P51965 193 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 MED21Q13503 144 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 AWAT1Q58HT5 328 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C6orf141Q5SZD1 244 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C16orf87Q6PH81 154 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 STX19Q8N4C7 294 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 SGCDQ92629 289 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 CHIAQ9BZP6 476 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 CHST6Q9GZX3 395 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 NEK6Q9HC98 313 aa12.86□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.86□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 OR2H2O95918 312 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 IGHV4-59P01825 116 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM225BP0DP42 221 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 GABRR1P24046 479 aa12.85□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 SAA4P35542 130 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR3A1P47881 315 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 EDDM3BP56851 147 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 EDDM3AQ14507 147 aa12.85□□□□□ -0.35
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SERF1B-208ENST00000515588 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 TBC1D15Q8TC07 691 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C17orf50Q8WW18 174 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 AJUBAQ96IF1 538 aa12.85□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa12.84□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 MEIOCA2RUB1 952 aa12.84□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 C17orf98A8MV24 154 aa12.84□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 SIRPB1O00241 398 aa12.84□□□□□ -0.35
SERF1B-208ENST00000515588 CDK1P06493 297 aa12.84□□□□□ -0.35
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