RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK14	Q6IE38	97 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS13	Q6UX07	377 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GALM	Q96C23	342 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN2	O60636	221 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CRYAA	P02489	173 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A4	P12235	298 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GABRA4	P48169	554 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CACNG5	Q9UF02	275 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ACACA	Q13085	2346 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GSK3A	P49840	483 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RAB13	P51153	203 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SST	P61278	116 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RNF212	Q495C1	297 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD1	Q8N668	190 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2M3	Q8NG83	312 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NMES1	Q9C002	83 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		7.09	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NGF	P01138	241 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IL9	P15248	144 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CALCR	P30988	508 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	KCNJ3	P48549	501 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CEBPE	Q15744	281 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PIGY	Q3MUY2	71 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC1B	Q9P126	229 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PHOX2A	O14813	284 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB25	P24278	435 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CEACAM6	P40199	344 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ROM1	Q03395	351 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB123	Q8N688	67 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD3	Q8WU67	409 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NTNG2	Q96CW9	530 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TECTB	Q96PL2	329 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GPR27	Q9NS67	375 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0G2JK05	382 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNHIT1	O43257	154 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HEXA	P06865	529 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CELA2A	P08217	269 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SELE	P16581	610 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FGF7	P21781	194 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SARAF	Q96BY9	339 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IP6K3	Q96PC2	410 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EDEM2	Q9BV94	578 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RAB33B	Q9H082	229 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		R4GN57	208 aa		7.08	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FREM3	P0C091	2139 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BTBD17	A6NE02	478 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PATE3	B3GLJ2	98 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A6	P12236	298 aa		7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EGR4	Q05215	589 aa		7.07	□□□□□ -1.28

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