RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491490.5

RHBDD1-213, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RHBDD1, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-213ENST00000491490 TACC2O95359 2948 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 A0A1B0GW55 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 UBE2QL1A1L167 161 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM221AA4D161 298 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 TMEM235A6NFC5 223 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FABP12A6NFH5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CLDN25C9JDP6 229 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 LDLRAD4O15165 306 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 HAND1O96004 215 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 IGHV4-39P01824 125 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 APOA1P02647 267 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 SELLP14151 372 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CFPP27918 469 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 SSTR2P30874 369 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 MNDAP41218 407 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CAPZA1P52907 286 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 TAS2R20P59543 309 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FGF12P61328 243 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 GPR176Q14439 515 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 EDDM3AQ14507 147 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 KRT74Q7RTS7 529 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 SETD6Q8TBK2 473 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RDH5Q92781 318 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB3CQ96E17 227 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 Q96M66 194 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 MRI1Q9BV20 369 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PPA2Q9H2U2 334 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 HMG20AQ9NP66 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 IL36GQ9NZH8 169 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NLKQ9UBE8 527 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DUX4Q9UBX2 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NPTNQ9Y639 398 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OOEPA6NGQ2 149 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OR2AT4A6NND4 320 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 SRRM5B3KS81 715 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PPIAL4DF5H284 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 TMEM178BH3BS89 294 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 H7C417 338 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 DEGS1O15121 323 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OR2H2O95918 312 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ADH4P08319 380 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB6AP20340 208 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 GATA4P43694 442 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ATP5J2P56134 94 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 COL10A1Q03692 680 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 LSAMPQ13449 338 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ARFRP1Q13795 201 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 ZMYND11Q15326 602 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB12Q6IQ22 244 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 Q6ZTK2 550 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 Q8IYB0 196 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OR8H2Q8N162 312 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 FGFRL1Q8N441 504 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 MFSD4AQ8N468 514 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 C14orf79Q96F83 325 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 WDFY2Q96P53 400 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-213ENST00000491490 CCL13Q99616 98 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms