RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1D-12P01611 117 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ATP1B3P54709 279 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 GDPD3Q7L5L3 318 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 Q8IYB0 196 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ACBD7Q8N6N7 88 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 PLXNB1O43157 2135 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 DUSP1P28562 367 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 FAM58AQ8N1B3 248 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF714Q96N38 554 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 CHST6Q9GZX3 395 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 CALCBP10092 127 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 POU3F4P49335 361 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 MTCP1P56278 107 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 LGALS4P56470 323 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 PDZK1IP1Q13113 114 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 EDDM3AQ14507 147 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 SPSB1Q96BD6 273 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf36Q96KX1 117 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 OPALINQ96PE5 141 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 SLC29A1Q99808 456 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 HHLA2Q9UM44 414 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXB3-211ENST00000490677 J3QLW9 94 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 MT-ND2P03891 347 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ARG1P05089 322 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 HTR1AP08908 422 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF19P17023 458 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 PRKACBP22694 351 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 OR3A1P47881 315 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 RAB13P51153 203 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 CFHR4Q92496 578 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 HMG20AQ9NP66 347 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 FOXJ3Q9UPW0 622 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 GRK1Q15835 563 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SPIN3Q5JUX0 258 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 LHFPL3Q86UP9 236 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 RFT1Q96AA3 541 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 MALSU1Q96EH3 234 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SPACA5Q96QH8 159 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 RAB18Q9NP72 206 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 TCF19Q9Y242 345 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 hADV38S2A0JD32 116 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 A6NDX4 124 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 MMP23AO75900 390 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 KDM4BO94953 1096 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF20P17024 532 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 PRKACAP17612 351 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 PEX2P28328 305 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 GALEQ14376 348 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 HERPUD1Q15011 391 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 PLA1AQ53H76 456 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ALG8Q9BVK2 526 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF702PQ9H963 129 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 E9PI62 339 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 MGST3O14880 152 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 GABRR1P24046 479 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SNU13P55769 128 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ACTA2P62736 377 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 ACTG2P63267 376 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SSX2Q16385 188 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 Q8N2B8 174 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SYS1Q8N2H4 156 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 LMO1P25800 156 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 DYNLT3P51808 116 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf88Q6PI97 169 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 KLHDC1Q8N7A1 406 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 APH1BQ8WW43 257 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 CDCA4Q9BXL8 241 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 AMBNQ9NP70 447 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-211ENST00000490677 SERTAD4Q9NUC0 356 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms