RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 HEXAP06865 529 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 PAX6P26367 422 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 UCNP55089 124 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZSR3 168 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 COMMD1Q8N668 190 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 POC1AQ8NBT0 407 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 GJC3Q8NFK1 279 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 S100A13Q99584 98 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TM2D1Q9BX74 207 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CALHM2Q9HA72 323 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 GPR84Q9NQS5 396 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FAM74A7A6NL05 159 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 IFNA2P01563 188 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 IFNA21P01568 189 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV3-1P01715 115 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FCGR2AP12318 317 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 OR3A4PP47883 348 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS3P57727 454 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 HFEQ30201 348 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 BEX5Q5H9J7 111 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 Q8NA96 180 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 WNT2BQ93097 391 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM230Q96A57 120 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 PGAM5Q96HS1 289 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 BOD1Q96IK1 185 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM8Q96KF7 97 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FOXB1Q99853 325 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 RNF126Q9BV68 326 aa8.31□□□□□ -1.08
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POLR1A-208ENST00000486964 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TREM1Q9NP99 234 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0A6YYD4 124 aa8.3□□□□□ -1.08
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POLR1A-208ENST00000486964 SYNGR3O43761 229 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS3O75911 302 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 JTBO76095 146 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CST4P01036 141 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CRYGSP22914 178 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 PTGFRP43088 359 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 NPY4RP50391 375 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CAV2P51636 162 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 F2RL1P55085 397 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TSC22D1Q15714 1073 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.3□□□□□ -1.08
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POLR1A-208ENST00000486964 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 TMED6Q8WW62 240 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SPSB1Q96BD6 273 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 APH1AQ96BI3 265 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 NICN1Q9BSH3 213 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 CHST5Q9GZS9 411 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-208ENST00000486964 BIN3Q9NQY0 253 aa8.3□□□□□ -1.08
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