RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 M0R1W7 72 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 KDM4BO94953 1096 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 IGKV1D-12P01611 117 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZP1P60852 638 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 RPL31P62899 125 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 BLMHQ13867 455 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 Q499Y3 187 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 SPIN3Q5JUX0 258 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 GPER1Q99527 375 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ESM1Q9NQ30 184 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 K7N7A8 449 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZNF737O75373 536 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 IGHV1-69P01742 117 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 TMEM225BP0DP42 221 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 CALCBP10092 127 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 CELP19835 753 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 SLC35A2P78381 396 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 RNLSQ5VYX0 342 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 Q8N7P7 452 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC22Q8N966 263 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 SPATA3Q8NHX4 192 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 RHOFQ9HBH0 211 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 HMG20AQ9NP66 347 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 GLS2Q9UI32 602 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PPH5 198 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 DUSP1P28562 367 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 VHLP40337 213 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 BDH1Q02338 343 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 DOC2BQ14184 412 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZNF146Q15072 292 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 GDPD3Q7L5L3 318 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 SATL1Q86VE3 508 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 OR8H2Q8N162 312 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 OR52N4Q8NGI2 321 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 CNBD2Q96M20 576 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 FAM192AQ9GZU8 254 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 CKLFQ9UBR5 152 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-208ENST00000481121 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 GABRPO00591 440 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 BAMBIQ13145 260 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DDI2Q5TDH0 399 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 SGCDQ92629 289 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ORAI1Q96D31 301 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 SNX22Q96L94 193 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 OR14A2Q96R54 314 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 TMEM138Q9NPI0 162 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 GABRR1P24046 479 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DLX1P56177 255 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 EDDM3BP56851 147 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 UBA52P62987 128 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 GUCA2AQ02747 115 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 FAM216AQ8WUB2 273 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DUX5Q96PT3 197 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 RAB26Q9ULW5 256 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 TMEM82A0PJX8 343 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ALDOBP05062 364 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 CD1AP06126 327 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 FSTP19883 344 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 BDKRB2P30411 391 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ACSM1Q08AH1 577 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 KLRD1Q13241 179 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 EDDM3AQ14507 147 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 MED22Q15528 200 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 NCR3LG1Q68D85 454 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 PXT1Q8NFP0 134 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 OR5D13Q8NGL4 314 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 CHST6Q9GZX3 395 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 DUSP21Q9H596 190 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 SIRPB1O00241 398 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 SH2D1BO14796 132 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 RGS10O43665 173 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-208ENST00000481121 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms