RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 TPBGQ13641 420 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MICBQ29980 383 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 STUMQ69YW2 141 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 WDR86Q86TI4 376 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR6V1Q8N148 313 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF511Q8NB15 262 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR52N1Q8NH53 320 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 P2RX4Q99571 388 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 COQ7Q99807 217 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC22A4Q9H015 551 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NUAK2Q9H093 628 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 COPS3Q9UNS2 423 aa5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS37A4D1T9 235 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CD300LBA8K4G0 201 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PRR32B1ATL7 298 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 E9PI62 339 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 XKRYO14609 159 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 AHCYL1O43865 530 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ALDOBP05062 364 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GRPP07492 148 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ACSM4P0C7M7 580 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T7P0C7T2 308 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CTLA4P16410 223 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ANOS1P23352 680 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR12D2P58182 307 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ACTC1P68032 377 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ACTA1P68133 377 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GALEQ14376 348 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 DGUOKQ16854 277 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TP53I3Q53FA7 332 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PLA1AQ53H76 456 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PGAP1Q75T13 922 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ADCK1Q86TW2 530 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NAA40Q86UY6 237 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TIGD4Q8IY51 512 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MKXQ8IYA7 352 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T4Q8NH00 348 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T27Q8NH04 317 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC29Q8WV35 223 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 UFD1Q92890 307 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM203Q969S6 136 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 C4orf36Q96KX1 117 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 GAFA1Q96PS6 74 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RERGLQ9H628 205 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 STUB1Q9UNE7 303 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 B9D1Q9UPM9 204 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 A6NIZ1 184 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 A6NLC8 198 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 J3QLW9 94 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SLC16A7O60669 478 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RHBDL1O75783 438 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 JTBO76095 146 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 TFF1P04155 84 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF19P17023 458 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CELP19835 753 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 MYCNOSP40205 109 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 SERPINB10P48595 397 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 VEGFCP49767 419 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 DYNLT3P51808 116 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 CAV3P56539 151 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ERVFRD-1P60508 538 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RAP1BP61224 184 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 RAP1AP62834 184 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 ECH1Q13011 328 aa5.73□□□□□ -1.49
CASQ1-203ENST00000481081 KCNMB1Q16558 191 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms