RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 LDLRAD4O15165 306 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 HAND1O96004 215 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 KNG1P01042 644 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 APOA1P02647 267 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 COL8A2P25067 703 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 VEGFCP49767 419 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BTG1P62324 171 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SCN1BQ07699 218 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 KCNJ8Q15842 424 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TAF9Q16594 264 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MPV17LQ2QL34 196 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NHLRC3Q5JS37 347 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TMEM69Q5SWH9 247 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 AVPI1Q5T686 147 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A1Q86YD7 464 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF525Q8N782 197 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DEFB108BQ8NET1 73 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NEK7Q8TDX7 302 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RAB40AQ8WXH6 277 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RAB1CQ92928 201 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NINJ1Q92982 152 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SEH1LQ96EE3 360 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DIRAS2Q96HU8 199 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CMTM3Q96MX0 182 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TM2D1Q9BX74 207 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GSX2Q9BZM3 304 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 LPAR5Q9H1C0 372 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DIABLOQ9NR28 239 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 15.6
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SIRPB1O00241 398 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 HSPB6O14558 160 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SH2D1BO14796 132 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 LHBP01229 141 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GYPAP02724 150 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CHRM2P08172 466 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PSG2P11465 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PAX1P15863 534 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ELK1P19419 428 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CDK2P24941 298 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DUSP1P28562 367 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 GABRA2P47869 451 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PITPNBP48739 271 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MADCAM1Q13477 382 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZNF146Q15072 292 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ZMYND11Q15326 602 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 STUMQ69YW2 141 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 RAB12Q6IQ22 244 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CNIH2Q6PI25 160 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 CHST4Q8NCG5 386 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 Q8NFD4 153 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 FAM168AQ92567 244 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 LURAP1Q96LR2 239 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 WDFY2Q96P53 400 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 ABCG5Q9H222 651 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.99□□□□□ -1.29
CNN3-205ENST00000474409 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms