RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00596Q86U02 117 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 POC1AQ8NBT0 407 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 SLC6A7Q99884 636 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 SYT3Q9BQG1 590 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 PLK3Q9H4B4 646 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.09□□□□□ -1.11
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GUH1 482 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 HMX3A6NHT5 357 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DISC1C4P0D8 188 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ABCD4O14678 606 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DHFRP00374 187 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 AMY2AP04746 511 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 GRPP07492 148 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRKACAP17612 351 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DTYMKP23919 212 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 HRH1P35367 487 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 SORDQ00796 357 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 MZT1Q08AG7 82 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ZMYND11Q15326 602 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 MICBQ29980 383 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ACTBL2Q562R1 376 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 Q6P435 159 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 Q8IYB0 196 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 OR4K15Q8NH41 348 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DYRK2Q92630 601 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 CHST6Q9GZX3 395 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 GHITMQ9H3K2 345 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 IFT22Q9H7X7 185 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 HES4Q9HCC6 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 NGBQ9NPG2 151 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 CA10Q9NS85 328 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DUSP13Q9UII6 198 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 LAMA5O15230 3695 aa8.08□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2QL1A1L167 161 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 H3BUI4 141 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PEX14O75381 377 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PMP2P02689 132 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 FCGR3AP08637 254 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 AMY2BP19961 511 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DUSP1P28562 367 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRR20EP86478 221 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRR20CP86479 221 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRR20DP86480 221 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRR20BP86481 221 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PRR20AP86496 221 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 CD300CQ08708 224 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 IKZF1Q13422 519 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 MPPED2Q15777 294 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ADIPOQQ15848 244 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 WDR82Q6UXN9 313 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZPA2 131 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 BEST4Q8NFU0 473 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 HPS1Q92902 700 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 GINS4Q9BRT9 223 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 EDARQ9UNE0 448 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 BSNQ9UPA5 3926 aa8.07□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0A6YYJ9 748 aa8.06□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.06□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 PLSCR5A0PG75 271 aa8.06□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 A6NLC8 198 aa8.06□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 SHISA9B4DS77 424 aa8.06□□□□□ -1.12
SRPRB-202ENST00000466636 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.06□□□□□ -1.12
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