RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447609.5

LMO3-209, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,365 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-209ENST00000447609 CST2P09228 141 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 QDPRP09417 244 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 NPIPA8P0DM63 369 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF708P17019 499 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF20P17024 532 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 NPY4RP50391 375 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ROM1Q03395 351 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SPOCK1Q08629 439 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 DCAF10Q5QP82 559 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 NAXEQ8NCW5 288 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR1P1Q8NH06 330 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 Q8WTZ3 238 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 LIPHQ8WWY8 451 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SPIN2AQ99865 258 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 WDR54Q9H977 334 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 R4GMQ9 66 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SCN2AQ99250 2005 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 NBASA2RRP1 2371 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 KCNAB3O43448 404 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 HCRTR2O43614 444 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ISG15P05161 165 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SOD3P08294 240 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SFTPDP35247 375 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CSNK1A1P48729 337 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 DCAF7P61962 342 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 VAMP2P63027 116 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SRPXP78539 464 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 DEGS2Q6QHC5 323 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SLC35G3Q8N808 338 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 DTD1Q8TEA8 209 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 HAS2Q92819 552 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 YPEL4Q96NS1 127 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 IFITM10A6NMD0 228 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ST8SIA3O43173 380 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF264O43296 627 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 DUSP1P28562 367 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF141Q15928 474 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 POM121Q96HA1 1249 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SYT3Q9BQG1 590 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 EHFQ9NZC4 300 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 AK3Q9UIJ7 227 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 PRR19A6NJB7 356 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 A8MVM7 634 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TM4SF5O14894 197 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 GDF1P27539 372 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 MSX1P28360 303 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 OR10J1P30954 320 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 CLN3Q13286 438 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 ZNF74Q16587 644 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 RAET1LQ5VY80 246 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-209ENST00000447609 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms