RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 HERVK_113P61574 105 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC7A9P82251 487 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CDNFQ49AH0 187 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CST9Q5W186 159 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MED27Q6P2C8 311 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 GAPTQ8N292 157 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NATD1Q8N6N6 113 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 COX18Q8N8Q8 333 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ESR2Q92731 530 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MARC2Q969Z3 335 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP170P1Q96L14 293 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 Q96MT0 163 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 VGLL1Q99990 258 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DERL2Q9GZP9 239 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM107BQ9H098 131 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CD84Q9UIB8 345 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 KLK13Q9UKR3 277 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MOKQ9UQ07 419 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC42Q9Y546 428 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPM7Q96QT4 1865 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DLEC1Q9Y238 1755 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA1AO00555 2505 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGB4P16144 1822 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 GJE1A6NN92 205 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MYL12BO14950 172 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TCAPO15273 167 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PI15O43692 258 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNGR1O43759 233 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 UGT2B11O75310 529 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V1G2O95670 118 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF224P0DH78 156 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R46P59540 309 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM10P62072 90 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS8Q16651 343 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 AVPI1Q5T686 147 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL9Q6T311 187 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC34A3Q8N130 599 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR26Q8NDV2 337 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1S1Q8NH92 325 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PIFOQ8TCI5 191 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NELFBQ8WX92 580 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MRAP2Q96G30 205 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM56Q96MV1 263 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB8Q9H765 288 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB22AQ9UL26 194 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 LTN1O94822 1766 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.42□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA1SQ13698 1873 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PCSK5Q92824 1860 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FUOMA2VDF0 154 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ARGFXA6NJG6 315 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 H0Y980 276 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP23AO75900 390 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT7LO94864 414 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYZL1O95825 349 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A27O95847 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 THY1P04216 161 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSLP07711 333 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TFPTP0C1Z6 253 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MLNP12872 115 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCR1P25024 350 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PAX6P26367 422 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CYB561P49447 251 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DLX6P56179 175 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNJ2BPP57105 145 aa3.41□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms