RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 TGFBR3Q03167 851 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PLP2Q04941 152 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 FMODQ06828 376 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 AESQ08117 197 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 RTTNQ86VV8 2226 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 H0YL77 283 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 H3BMH7 237 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GPR75O95800 540 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 C1SP09871 688 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MMP9P14780 707 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PTGER4P35408 488 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 TSPAN7P41732 249 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF117Q03924 483 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 HSD17B8Q92506 261 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PTGER1P34995 402 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GJA4P35212 333 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 EXT1Q16394 746 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ARPC3O15145 178 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM20O43506 726 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DQA1P01909 254 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 RAC1P63000 192 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 C10orf111Q8N326 155 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ERGIC1Q969X5 290 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PDFQ9HBH1 243 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 JKAMPQ9P055 326 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ABI3Q9P2A4 366 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PRSS37A4D1T9 235 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PCBD1P61457 104 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 RARRES2Q99969 163 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 LIMS1P48059 325 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 CUTCQ9NTM9 273 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 TNFSF13O75888 250 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 DUSP5Q16690 384 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 OR52N5Q8NH56 324 aa5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 APBB3O95704 486 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ATP6V0CP27449 155 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 AGERQ15109 404 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 HOGA1Q86XE5 327 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MKXQ8IYA7 352 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 MUCL1Q96DR8 90 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 NUDT3O95989 172 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GZMBP10144 247 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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SBNO1-202ENST00000420886 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 LANCL2Q9NS86 450 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 IGLV3-25P01717 112 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GALNSP34059 522 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 IER3P46695 156 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 CSN1S1P47710 185 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 RGRP47804 291 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 GGTLC2Q14390 218 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.75□□□□□ -1.49
SBNO1-202ENST00000420886 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.75□□□□□ -1.49
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