RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PIEZO1Q92508 2521 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 COL8A2P25067 703 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LHX2P50458 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GABREP78334 506 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S1P78537 153 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf30Q96GV9 206 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CKLFQ9UBR5 152 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DKKL1Q9UK85 242 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR3BO95264 441 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EDN3P14138 238 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1A1P50225 295 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RND3P61587 244 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SKP1P63208 163 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ICAM4Q14773 271 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 REEP6Q96HR9 211 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KPTNQ9Y664 436 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5H15A6NDH6 313 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A8P05109 93 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL16Q0P5N6 197 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DCUN1D4Q92564 292 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 VDAC3Q9Y277 283 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS44E7EML9 344 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DHHO43323 396 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 XRCC2O43543 280 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 JTBO76095 146 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CELA2AP08217 269 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1C3P42330 323 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GFRA1P56159 465 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PPA1Q15181 289 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR157Q5UAW9 335 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGQQ9BRB3 760 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WWC5 75 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPTL7O43827 346 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MYF5P13349 255 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NHLH2Q02577 135 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8WTZ3 238 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA60Q9H7X0 242 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CSN2P05814 226 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NPPCP23582 126 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CPT2P23786 658 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TLE3Q04726 772 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOBQ15370 118 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GUK1Q16774 197 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf88Q6PI97 169 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CD207Q9UJ71 328 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MSX1P28360 303 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGR2CP31995 323 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD9Q7L273 389 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 H2BFMP0C1H6 154 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NME2P22392 152 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RRADP55042 308 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1D5P58170 312 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PEA15Q15121 130 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
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