RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379236.3

TNFRSF4-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF4, Length 1,068 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4-201ENST00000379236 KLHL22Q53GT1 634 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 PPA2Q9H2U2 334 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 hADV38S2A0JD32 116 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZNF737O75373 536 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 IGHA1P01876 353 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZNF728P0DKX0 622 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 NPBWR2P48146 333 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 LY6EQ16553 131 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 TREML4Q6UXN2 200 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 Q6ZSV7 163 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZNF714Q96N38 554 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 CHST6Q9GZX3 395 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF4-201ENST00000379236 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TMEM212A6NML5 194 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 C17orf98A8MV24 154 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TIMM23O14925 209 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 HCKP08631 526 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 CALCBP10092 127 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 DUSP1P28562 367 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 PDZK1IP1Q13113 114 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 C17orf50Q8WW18 174 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 RDH12Q96NR8 316 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 RAB18Q9NP72 206 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 IL36RNQ9UBH0 155 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 DHDHQ9UQ10 334 aa20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 RBP4P02753 201 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 ARG1P05089 322 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SPACA5Q96QH8 159 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 CITED1Q99966 193 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MEGF9Q9H1U4 602 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 C16orf95Q9H693 158 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TMEM82A0PJX8 343 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 M0QZ24 198 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SIRPB1O00241 398 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SH2D1BO14796 132 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MT-ND2P03891 347 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZNF146Q15072 292 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 AANATQ16613 207 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 HMG20AQ9NP66 347 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MGAM2Q2M2H8 2515 aa20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MGST3O14880 152 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TSPAN9O75954 239 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 CLPXO76031 633 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 DLX6P56179 175 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TPRX1Q8N7U7 411 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 FUOMA2VDF0 154 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MAGEB3O15480 346 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZFPL1O95159 310 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 PAX6P26367 422 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 PROK1P58294 105 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 PLA1AQ53H76 456 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 LPCAT4Q643R3 524 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 APH1BQ8WW43 257 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 RHOFQ9HBH0 211 aa20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 IRGMA1A4Y4 181 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SULT1B1O43704 296 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 KDM4BO94953 1096 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 TMEM225BP0DP42 221 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 ZNF44P15621 663 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 GABRA5P31644 462 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SCN1BQ07699 218 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 SLC35E4Q6ICL7 350 aa20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF4-201ENST00000379236 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms