RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368460.7

PBXIP1-201, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene PBXIP1, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-201ENST00000368460 LRGUKQ96M69 825 aa14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 COPS3Q9UNS2 423 aa14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 R4GMQ9 66 aa14.69□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM172BPA6NC97 362 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CYB5AP00167 134 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 IGHA1P01876 353 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RAP2AP10114 183 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 THBS3P49746 956 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RAB25P57735 213 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 BDH1Q02338 343 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF329Q86UD4 541 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 Q8IYB0 196 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 BORCS8Q96FH0 119 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.68□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RYR3Q15413 4870 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 PRR32B1ATL7 298 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 F8VVB4 439 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 F8VWA3 439 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 MGST3O14880 152 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CDK2P24941 298 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CXCR4P61073 352 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CDK5Q00535 292 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ODF4Q2M2E3 257 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 APOL4Q9BPW4 351 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ADI1Q9BV57 179 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.67□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 FUOMA2VDF0 154 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 H3BSH0 61 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SNX3O60493 162 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RAMP3O60896 148 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 MMP23AO75900 390 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SERPINA3P01011 423 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM106CPP0CH98 169 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 DUSP1P28562 367 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 MYCNOSP40205 109 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 FUT6P51993 359 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 P2RX3P56373 397 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 A0A1B0GTI1 187 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 CCDC182A6NF36 153 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 H0YHG0 523 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 C3orf84H3BNL1 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SYT7O43581 403 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC6A1P30531 599 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 OR3A4PP47883 348 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 POU3F4P49335 361 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 PRRX1P54821 245 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC35B1P78383 322 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF91Q05481 1191 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 ZFP57Q9NU63 452 aa14.65□□□□□ -0.06
PBXIP1-201ENST00000368460 SERPINE3A8MV23 424 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 SIRPB1O00241 398 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PSPNO60542 156 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 AMY1AP04745 511 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 AMY2AP04746 511 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ANXA8P13928 327 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 PRKACAP17612 351 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 HES1Q14469 280 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.64□□□□□ -0.07
PBXIP1-201ENST00000368460 RPEQ96AT9 228 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms