RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD60Q9BZ19 345 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 STAB1Q9NY15 2570 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PTGES3LE9PB15 166 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 K7N7A8 449 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 HAND1O96004 215 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5AP00167 134 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-69P01742 117 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3AP20336 220 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF273Q14593 569 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR52N4Q8NGI2 321 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF14Q92956 283 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 VCX3BQ9H321 246 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 NEK6Q9HC98 313 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 HMG20AQ9NP66 347 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM77I1YAP6 450 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 M0R1W7 72 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GABRPO00591 440 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PSPNO60542 156 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CD2P06729 351 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CHRM2P08172 466 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CCL3L1P16619 93 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R43P59537 309 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 BAMBIQ13145 260 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RIPK1Q13546 671 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF146Q15072 292 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PNKDQ8N490 385 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZFAND2BQ8WV99 257 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR5M11Q96RB7 305 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CHST6Q9GZX3 395 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0U1RQK1 487 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRD5 423 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRF3 423 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRM7 423 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM225BP0DP42 221 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CELP19835 753 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 BPIFB3P59826 476 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ERVFRD-1P60508 538 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35A2P78381 396 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 Q499Y3 187 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 YIF1BQ5BJH7 314 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RNLSQ5VYX0 342 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 HCP5Q6MZN7 132 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TCF23Q7RTU1 214 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SATL1Q86VE3 508 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR8H2Q8N162 312 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf42Q8N5U0 333 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FAM216AQ8WUB2 273 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SNX22Q96L94 193 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR14A2Q96R54 314 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SCN3BQ9NY72 215 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPK0 400 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SIRPB1O00241 398 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR2H2O95918 312 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GABRR1P24046 479 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PRTN3P24158 256 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR3A1P47881 315 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR3A4PP47883 348 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 EDDM3BP56851 147 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 EDDM3AQ14507 147 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IRF3Q14653 427 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DDI2Q5TDH0 399 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR10K1Q8NGX5 313 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MYDGFQ969H8 173 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CNBD2Q96M20 576 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GPER1Q99527 375 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MND1Q9BWT6 205 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms