RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 STARD10Q9Y365 291 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PR80 420 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 F6UZH7 168 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TTRP02766 147 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 GABRA2P47869 451 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TNFSF10P50591 281 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SGCBQ16585 318 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF738Q8NE65 137 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PTX4Q96A99 478 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ACY3Q96HD9 319 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 RTTNQ86VV8 2226 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PPV9 198 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 LRP5LA4QPB2 252 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C2orf72A6NCS6 295 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TFPI2P48307 235 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 RRADP55042 308 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 BRICD5Q6PL45 260 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PIGCQ92535 297 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 VAX2Q9UIW0 290 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ADH1BP00325 375 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ERVFRD-1P60508 538 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 22.8
PACS1-201ENST00000320580 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PRR32B1ATL7 298 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TNFP01375 233 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 BMP5P22003 454 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PTGER4P35408 488 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MFAP5Q13361 173 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 IL21Q9HBE4 155 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A8MWP6 167 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 H0Y8G0 127 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 AMBPP02760 352 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR4X1Q8NH49 305 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 POC1BQ8TC44 478 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 BCL2P10415 239 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 OTX2P32243 289 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 KISS1Q15726 138 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 APH1AQ96BI3 265 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PRSS38A1L453 326 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FAHP16930 419 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 DTYMKP23919 212 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FAM53BQ14153 422 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CA13Q8N1Q1 262 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 UHRF2Q96PU4 802 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A22Q9H936 323 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PSENENQ9NZ42 101 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SPINK4O60575 86 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HSF1Q00613 529 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR5G3P0C626 314 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PDCD1Q15116 288 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A087WWC5 75 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 B4E171 279 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MSR1P21757 451 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF117Q03924 483 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CSRP2Q16527 193 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PECRQ9BY49 303 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FOXQ1Q9C009 403 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.65□□□□□ -0.06
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