RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	HES4	Q9HCC6	221 aa		14.95	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM25A	B3EWG3	89 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM25C	B3EWG5	89 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM25G	B3EWG6	89 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NDUFS7	O75251	213 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LHB	P01229	141 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GTF2F2	P13984	249 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CFHR2	P36980	270 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP10-9	P60411	292 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FGF12	P61328	243 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM201A	Q5SY85	155 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CDH24	Q86UP0	819 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	HMG20A	Q9NP66	347 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SRRM5	B3KS81	715 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		H7C417	338 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OVOL3	O00110	214 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	INHBB	P09529	407 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LYNX1	P0DP58	116 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PRKACA	P17612	351 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CDK2	P24941	298 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR176	Q14439	515 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PDCD1	Q15116	288 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF787	Q6DD87	383 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MFSD4A	Q8N468	514 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ERGIC1	Q969X5	290 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CMTM3	Q96MX0	182 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		V9GYH0	126 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB27B	O00194	218 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SOCS1	O15524	211 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NXPH2	O95156	264 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DUSP1	P28562	367 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	VEGFC	P49767	419 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TAF9	Q16594	264 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MARVELD3	Q96A59	401 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TSC22D3	Q99576	134 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TM2D1	Q9BX74	207 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF205	O95201	554 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GLRA1	P23415	457 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	COL8A2	P25067	703 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CCL17	Q92583	94 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	YIPF5	Q969M3	257 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SOST	Q9BQB4	213 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF7	Q9UBF6	113 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ITPR2	Q14571	2701 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TFF1	P04155	84 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GABRR1	P24046	479 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CD80	P33681	288 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ETV6	P41212	452 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM50B	P56557	158 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		Q8IYB0	196 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CCL19	Q99731	98 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RANBP1	P43487	201 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF79	Q15937	498 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0G2JMP0	313 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0X1KG70	313 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM178B	H3BS89	294 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PTHLH	P12272	177 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CPT2	P23786	658 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PITPNB	P48739	271 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PTH2R	P49190	550 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		14.9	□□□□□ -0.02

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