RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 COL7A1Q02388 2944 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ODF3BA8MYP8 253 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 F8VVB4 439 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 F8VWA3 439 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 EBAG9O00559 213 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 EI24O14681 340 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF737O75373 536 aa8.24□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 HTR1FP30939 366 aa8.24□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 COL10A1Q03692 680 aa8.24□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 LYG1Q8N1E2 194 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 DTX3Q8N9I9 347 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TCF19Q9Y242 345 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.24□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 H3BSH0 61 aa8.23□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ARG1P05089 322 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ALPLP05186 524 aa8.23□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 ALDH3A2P51648 485 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 EDDM3BP56851 147 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 CDC42P60953 191 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TMED1Q13445 227 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 FAM189A2Q15884 450 aa8.23□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 SSX6Q7RTT6 188 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM219Q86XT9 240 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 Q8N2B8 174 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.23□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 RFKQ969G6 155 aa8.23□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 A6NDX4 124 aa8.22□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 OR2T7P0C7T2 308 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 CD28P10747 220 aa8.22□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 TCF23Q7RTU1 214 aa8.22□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.22□□□□□ -1.09
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MFGE8-216ENST00000613965 EME1Q96AY2 570 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF714Q96N38 554 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 TBX5Q99593 518 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.22□□□□□ -1.09
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM82A0PJX8 343 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 INMTO95050 263 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 APOL3O95236 402 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ATP6V1E1P36543 226 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 DYNLT3P51808 116 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 FUT6P51993 359 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ACTA2P62736 377 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ACTG2P63267 376 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ACTC1P68032 377 aa8.21□□□□□ -1.1
MFGE8-216ENST00000613965 ACTA1P68133 377 aa8.21□□□□□ -1.1
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