RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 PALMDQ9NP74 551 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 NPTNQ9Y639 398 aa6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FABP12A6NFH5 140 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf100A8MU93 164 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FAM25AB3EWG3 89 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FAM25CB3EWG5 89 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FAM25GB3EWG6 89 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SHISA9B4DS77 424 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFA2O43678 99 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CA11O75493 328 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FSTL3O95633 263 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PLATP00750 562 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PMELP40967 661 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MNDAP41218 407 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 HAAOP46952 286 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 AP3S2P59780 193 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TLE4Q04727 773 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 LSAMPQ13449 338 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY14Q15391 338 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ADIPOQQ15848 244 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MPV17LQ2QL34 196 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FAM166AQ6J272 317 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 VHLLQ6RSH7 139 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR5AS1Q8N127 324 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CHST4Q8NCG5 386 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR51F2Q8NH61 342 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR51B6Q9H340 312 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 OR51I2Q9H344 312 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 RAB9BQ9NP90 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 DLL4Q9NR61 685 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 GPR173Q9NS66 373 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ING4Q9UNL4 249 aa6.23□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 FUOMA2VDF0 154 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 A6NLC8 198 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINE3A8MV23 424 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SULT1C2O00338 296 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 XRCC3O43542 346 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 GSTT2BP0CG30 244 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ADRA2CP18825 462 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CBX5P45973 191 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 KCNJ3P48549 501 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PITPNBP48739 271 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 POU3F4P49335 361 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MMP15P51511 669 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 GPM6AP51674 278 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 IL13RA2Q14627 380 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 INSL4Q14641 139 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 HES5Q5TA89 166 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 Q8NFD4 153 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 Q8TCH9 128 aa6.22□□□□□ -1.41
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