RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		H3BSH0	61 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		J3QLW9	94 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	GPR137B	O60478	399 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	IGHA1	P01876	353 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	OCM2	P0CE71	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF19	P17023	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	KLRD1	Q13241	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	BAG2	O95816	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	RBP4	P02753	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	MT-ND2	P03891	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	CCDC159	P0C7I6	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ATF1	P18846	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	MTCP1	P56278	107 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	COL10A1	Q03692	680 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	FGGY	Q96C11	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF737	O75373	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OMG	P23515	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	AANAT	Q16613	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	SNX22	Q96L94	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ALX3	O95076	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	TGFBR2	P37173	567 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	POU3F4	P49335	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	RELB	Q01201	579 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF146	Q15072	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537		A0A1W2PRD5	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537		A0A1W2PRF3	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537		A0A1W2PRM7	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537		F8VVB4	439 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537		F8VWA3	439 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	HAND1	O96004	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PEX2	P28328	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	DLX1	P56177	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	LGALS4	P56470	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	EDDM3B	P56851	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NFIC-208	ENST00000589537	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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