RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	AGA	P20933	346 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	PAX6	P26367	422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	FABP1	P07148	127 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	NQO2	P16083	231 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ECI1	P42126	302 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	P2RY1	P47900	373 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	SULT1A1	P50225	295 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB30	Q15771	203 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	RARRES2	Q99969	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	DHH	O43323	396 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	TXNL1	O43396	289 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB5A	P20339	215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	H3F3A	P84243	136 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GPR37	O15354	613 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	CA11	O75493	328 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GLP1R	P43220	463 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	PPA1	Q15181	289 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	HMGN3	Q15651	99 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG16-205	ENST00000587743	GPR137B	O60478	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	DKK1	O94907	266 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ITGA3	P26006	1051 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CLINT1	Q14677	625 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SHB	Q15464	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	RNF212	Q495C1	297 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743		Q6ZPA2	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CHAT	P28329	748 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	OMG	P23515	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	UCP2	P55851	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CCL20	P78556	96 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743		H7C1Q1	480 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG16-205	ENST00000587743	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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