RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MNTQ99583 582 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 FUZQ9BT04 418 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR51I2Q9H344 312 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC22A2O15244 555 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GADD45GO95257 159 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RBP4P02753 201 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TK1P04183 234 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GYPBP06028 91 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 H2BFMP0C1H6 154 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF728P0DKX0 622 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NCK1P16333 377 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GALP22466 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 DLX6P56179 175 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SCAND1P57086 179 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 IL18R1Q13478 541 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OSR2Q8N2R0 312 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00471Q8N535 108 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 AQP3Q92482 292 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 STMN2Q93045 179 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LYZL4Q96KX0 146 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PRR25Q96S07 402 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PSMB11A5LHX3 300 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PGA5P0DJD9 388 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA8P13928 327 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CD24P25063 80 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 BRS3P32247 399 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 BMI1P35226 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GSSP48637 474 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PPP5CP53041 499 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RAB25P57735 213 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACTA2P62736 377 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACTG2P63267 376 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACTC1P68032 377 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACTA1P68133 377 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CBX1P83916 185 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TSPAN31Q12999 210 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 POC1AQ8NBT0 407 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RCN3Q96D15 328 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 C7orf34Q96L11 122 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF488Q96MN9 340 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ABHD6Q9BV23 337 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 VNN3Q9NY84 501 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR5B21A6NL26 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NME4O00746 187 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ST8SIA5O15466 376 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NXPH2O95156 264 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CLUP10909 449 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SPI1P17947 270 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HTR1DP28221 377 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CHATP28329 748 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC6A1P30531 599 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OPRL1P41146 370 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ECI1P42126 302 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MAP2K3P46734 347 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT2P50583 147 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 EDDM3BP56851 147 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CRMP1Q14194 572 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01559Q495D7 138 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PET117Q6UWS5 81 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MOB3CQ70IA8 216 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SHFQ7M4L6 423 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF329Q86UD4 541 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms