RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR8S1Q8NH09 359 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 APH1BQ8WW43 257 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 COPS4Q9BT78 406 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR2AT4A6NND4 320 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 VGLL3A8MV65 326 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TBX1O43435 398 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PRKYO43930 277 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 HLA-DQA2P01906 255 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 GYPBP06028 91 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CLUP10909 449 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PSG2P11465 335 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 MYF6P23409 242 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 POU1F1P28069 291 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 DRAM2Q6UX65 266 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CD177Q8N6Q3 437 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 MYDGFQ969H8 173 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SPTSSAQ969W0 71 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SGK3Q96BR1 496 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 REEP6Q96HR9 211 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF488Q96MN9 340 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SP140LQ9H930 580 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RAB18Q9NP72 206 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 NLKQ9UBE8 527 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RAB26Q9ULW5 256 aa6.32□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 XRCC2O43543 280 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RENP00797 406 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SPARCP09486 303 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PF4V1P10720 104 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 GRK5P34947 590 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CX3CR1P49238 355 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SLC35A2P78381 396 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PRDX4Q13162 271 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TTC23Q5W5X9 447 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 KCNJ15Q99712 375 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 IFT27Q9BW83 186 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 VCX3BQ9H321 246 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 U3KQK5 164 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 HERC2O95714 4834 aa6.31□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF878C9JN71 531 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 H3BN98 237 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 IDH3BO43837 385 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CHRM2P08172 466 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SLC2A5P22732 501 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SLC6A6P31641 620 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 GABRA2P47869 451 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 HSPA13P48723 471 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 IL18R1Q13478 541 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 CRMP1Q14194 572 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 FAM57BQ71RH2 274 aa6.3□□□□□ -1.4
RD3L-201ENST00000557640 RNF144BQ7Z419 303 aa6.3□□□□□ -1.4
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