RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	ARL6IP5	O75915	188 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NUDT14	O95848	222 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	AGR2	O95994	175 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ITGA5	P08648	1049 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	DAO	P14920	347 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	RAB4A	P20338	218 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PYCR1	P32322	319 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ATP1B3	P54709	279 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	RAC3	P60763	192 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NHLH2	Q02577	135 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF9	Q07011	255 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	FUT5	Q11128	374 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	LIPN	Q5VXI9	398 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NIPAL3	Q6P499	406 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	DRAM2	Q6UX65	266 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ABHD3	Q8WU67	409 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NEURL3	Q96EH8	262 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	C18orf12	Q96KH6	178 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF607	Q96SK3	696 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	COMMD9	Q9P000	198 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ACOD1	A6NK06	481 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984		H7C417	338 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	HMGN4	O00479	90 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CCS	O14618	274 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CYTIP	O60759	359 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PMS2P2	O95744	297 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CD14	P08571	375 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OR4E1	P0C645	316 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CRABP1	P29762	137 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CD80	P33681	288 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OMP	P47874	163 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TAS2R20	P59543	309 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SYPL1	Q16563	259 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984		Q5PR19	223 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	GID4	Q8IVV7	300 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	BAP18	Q8IXM2	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	HAVCR1	Q96D42	359 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SEC22A	Q96IW7	307 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CCL19	Q99731	98 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF724	A8MTY0	619 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984		H7C1Q1	480 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PLAU	P00749	431 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	CSTA	P01040	98 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	IFNA17	P01571	189 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ARG1	P05089	322 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PGC	P20142	388 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	OR3A2	P47893	321 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NAAA	Q02083	359 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PLAUR	Q03405	335 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF85	Q03923	595 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM234	Q8WY98	164 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	TEX12	Q9BXU0	123 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FGD4-215	ENST00000551984	DOK5	Q9P104	306 aa		5.62	□□□□□ -1.51

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