RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549076.1

ARFGAP1-222, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 2

Gene ARFGAP1, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EBAG9	O00559	213 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	INMT	O95050	263 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ISG15	P05161	165 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CCR9	P51686	369 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MTCP1	P56278	107 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR12D2	P58182	307 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	COL10A1	Q03692	680 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076		J3QLW9	94 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076		J3QRE1	110 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076		M0QZ24	198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TIMM23	O14925	209 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF19	P17023	458 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EDDM3B	P56851	147 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FGGY	Q96C11	551 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SSX3	Q99909	188 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076		H3BUX3	64 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CCL3L1	P16619	93 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ATF1	P18846	271 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	COX7A1	P24310	79 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	POU3F4	P49335	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AANAT	Q16613	207 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q6ZSV7	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SNX22	Q96L94	193 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CITED1	Q99966	193 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ARFGAP1-222	ENST00000549076	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076		F8VVB4	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076		F8VWA3	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF737	O75373	536 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TSPAN9	O75954	239 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CLPX	O76031	633 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HAND1	O96004	215 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RBP4	P02753	201 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GABRR1	P24046	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PEX2	P28328	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF273	Q14593	569 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076		E9PQ18	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PROK1	P58294	105 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RAB40B	Q12829	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GALE	Q14376	348 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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