RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 HES4Q9HCC6 221 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 USE1Q9NZ43 259 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 AASSQ9UDR5 926 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 F8VVB4 439 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 F8VWA3 439 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 H3BNX3 289 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 H3BUX3 64 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 K7N7A8 449 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 EBAG9O00559 213 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SLC16A6O15403 523 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 KCNAB3O43448 404 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 CALCBP10092 127 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 CCL3L1P16619 93 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 COX7A1P24310 79 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 KIR3DL2P43630 455 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 POU3F4P49335 361 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ERVK11-1P61568 191 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 LY6EQ16553 131 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 MIDNQ504T8 468 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZSV7 163 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 C17orf50Q8WW18 174 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 PP6455Q8WZ26 134 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 Q96MT0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 GLS2Q9UI32 602 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 M0QZ24 198 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 TIMM23O14925 209 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 BAG2O95816 211 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ARG1P05089 322 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ISG15P05161 165 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ATF1P18846 271 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 PRKACBP22694 351 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 GABRR1P24046 479 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 PEX2P28328 305 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF273Q14593 569 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 Q8IYB0 196 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 C4orf36Q96KX1 117 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 SNX22Q96L94 193 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-222ENST00000540445 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-222ENST00000540445 C17orf98A8MV24 154 aa7.33□□□□□ -1.24
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LMO3-222ENST00000540445 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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LMO3-222ENST00000540445 CCR9P51686 369 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 BMXP51813 675 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP10-3P60369 221 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ISL1P61371 349 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 SCN1BQ07699 218 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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