RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528150.1

USP33-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, human

TSL 3

Gene USP33, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP33-215	ENST00000528150	DCK	P27707	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	UBE2E1	P51965	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	AMBN	Q9NP70	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	FCN3	O75636	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	TK1	P04183	234 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	CD2	P06729	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	HCK	P08631	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	LGALS4	P56470	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	IL18R1	Q13478	541 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	RCN1	Q15293	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	DYRK2	Q92630	601 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP33-215	ENST00000528150		A0A0U1RQK1	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	TFF1	P04155	84 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	PEX2	P28328	305 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	EDDM3B	P56851	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SNX22	Q96L94	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150		K7N7A8	449 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SH2D1B	O14796	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	INMT	O95050	263 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MT-ND2	P03891	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	BMX	P51813	675 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	COL10A1	Q03692	680 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MIDN	Q504T8	468 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	HAND1	O96004	215 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	PRKACA	P17612	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	GABRR1	P24046	479 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	RAG2	P55895	527 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150		Q8N7P7	452 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	GPER1	Q99527	375 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150		A0A1W2PRD5	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP33-215	ENST00000528150		A0A1W2PRF3	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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