RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527655.5

EDRF1-212, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene EDRF1, Length 851 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-212ENST00000527655 GRPRP30550 384 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CSNK1A1P48729 337 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TGM4P49221 684 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 HSF2Q03933 536 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 C2orf54Q08AI8 447 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 EPS8Q12929 822 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR8B8Q15620 311 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ZNF79Q15937 498 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CFAP157Q5JU67 520 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 LYG2Q86SG7 212 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR8G5Q8NG78 346 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ARPC1AQ92747 370 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 RHOJQ9H4E5 214 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TUBA4BQ9H853 241 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 I3L521 148 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 FAAHO00519 579 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OVOL1O14753 267 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 NDUFA2O43678 99 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR4F21O95013 312 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 RENP00797 406 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 C1QCP02747 245 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GKN3PP0CG01 181 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GFAPP14136 432 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ZNF823P16415 610 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 MGMTP16455 207 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CXCR1P25024 350 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GGT2P36268 569 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CD200P41217 278 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 UBE2HP62256 183 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 IRF3Q14653 427 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 DGUOKQ16854 277 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 SLC36A2Q495M3 483 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TTC27Q6P3X3 843 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 C4orf22Q6V702 233 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TMEM106AQ96A25 262 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CFAP36Q96G28 342 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 CCDC42Q96M95 316 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ANP32EQ9BTT0 268 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GLTPQ9NZD2 209 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ADA2Q9NZK5 511 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 TEX264Q9Y6I9 313 aa3.12□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 LRRN3E7EW58 273 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 H0Y9J4 135 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 AIM2O14862 343 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 AHSA1O95433 338 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 IGLV1-51P01701 117 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 IRF2P14316 349 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 GSTM3P21266 225 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ZNF75DP51815 510 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 BIDP55957 195 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 ERVK-25P63136 954 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 KCNJ8Q15842 424 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 PCK2Q16822 640 aa3.11□□□□□ -1.91
EDRF1-212ENST00000527655 Q1RN00 199 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms