RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 RFT1Q96AA3 541 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SEH1LQ96EE3 360 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SDSLQ96GA7 329 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF488Q96MN9 340 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFB11Q9NX14 153 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CTSZQ9UBR2 303 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A087WXM4 84 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CCRL2O00421 344 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 GABRA2P47869 451 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 HSD17B12Q53GQ0 312 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SPIN3Q5JUX0 258 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 Q71RC1 249 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM58AQ8N1B3 248 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A13Q99584 98 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF222Q9UK12 451 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 LOC105371242A0A075B767 164 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPK0 400 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RFPL4AA6NLU0 287 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 DVL1O14640 695 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 LIPFP07098 398 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 UCHL1P09936 223 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMB9P28065 219 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDX2P32119 198 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5D18Q8NGL1 313 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM203Q969S6 136 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 GAFA1Q96PS6 74 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 WNK2Q9Y3S1 2297 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 GABRPO00591 440 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PIN1P1O15428 100 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ENSAO43768 121 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRM2P08172 466 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 BCL3P20749 454 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PTGFRP43088 359 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RANBP1P43487 201 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 MTNR1BP49286 362 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CAV3P56539 151 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS25P62851 125 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 UQCC2Q9BRT2 126 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ANGPTL7O43827 346 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SRMP19623 302 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR176Q14439 515 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF146Q15072 292 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CR1LQ2VPA4 569 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ELP2Q6IA86 826 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ASCL4Q6XD76 172 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM234AQ9H0X4 552 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL9Q9H1A3 318 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 HMG20AQ9NP66 347 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 IL36GQ9NZH8 169 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 MAS1P04201 325 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 AMY2BP19961 511 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 NPBWR2P48146 333 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RSU1Q15404 277 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SSX1Q16384 188 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 GLT8D1Q68CQ7 371 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ST8SIA4Q92187 359 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ORAI1Q96D31 301 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 MRI1Q9BV20 369 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 OR14J1Q9UGF5 321 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 INAFM1C9JVW0 142 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-12P01611 117 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKACAP17612 351 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 IKZF1Q13422 519 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM91Q6ZNR0 172 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 JAGN1Q8N5M9 183 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-212ENST00000508338 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms