RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 FOXK1P85037 733 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF561Q8N587 486 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 SPTA1P02549 2419 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1W2PPV4 95 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CDK2AP1O14519 115 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ABCD4O14678 606 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 HLA-HP01893 362 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CD74P04233 296 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 MST1P26927 711 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CHST5Q9GZS9 411 aa11.65□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CACNA1DQ01668 2161 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 TTLL8A6PVC2 850 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RNF212BA8MTL3 300 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 CELA2AP08217 269 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PGA4P0DJD7 388 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PGA3P0DJD8 388 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ERVK-16P61578 105 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.65□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RAC3P60763 192 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ADIRFQ15847 76 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RAB33BQ9H082 229 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM10O14672 748 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 BAXQ07812 192 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 CST9LP1Q5W188 147 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 WNT16Q9UBV4 365 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 DAOP14920 347 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PTAFRP25105 342 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 UNC119Q13432 240 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 OR2C3Q8N628 320 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ISOC2Q96AB3 205 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 GNG12Q9UBI6 72 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R2P9O14990 202 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 NQO2P16083 231 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PIGYQ3MUY2 71 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF573Q86YE8 665 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.64□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM20O43506 726 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 GABRA2P47869 451 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RAB1AP62820 205 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ACER2Q5QJU3 275 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SEC11CQ9BY50 192 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 MMP24Q9Y5R2 645 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1W2PR77 199 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 H7C1Q1 480 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 MALSU1Q96EH3 234 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 OR10C1Q96KK4 312 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SOX7Q9BT81 388 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 NFYBP25208 207 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PLAURQ03405 335 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJC13O75165 2243 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 CD8AP01732 235 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 RD3LP0DJH9 198 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SRD5A2P31213 254 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 NAAAQ02083 359 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.62□□□□□ -0.55
SPCS3-201ENST00000503362 COMMD1Q8N668 190 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms