RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNKD	Q8N490	385 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	BOD1	Q96IK1	185 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SGCZ	Q96LD1	299 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf45	Q96LM5	186 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LPAR4	Q99677	370 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PELI2	Q9HAT8	420 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDH20	Q9HBT6	801 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABI3	Q9P2A4	366 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GWA3	101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12B	A1L429	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSTM5	A8MXK1	200 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CORT	O00230	105 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCN1	O00602	326 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSBP1	O75506	76 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFSF15	O95150	251 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPL	P40238	635 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINT3	P49223	89 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSEN2	P49810	448 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTCP1	P56278	107 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN2	P57739	230 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ID2	Q02363	134 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MLC1	Q15049	377 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SHH	Q15465	462 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VASH2	Q86V25	355 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF11	Q92914	225 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALG14	Q96F25	216 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRG3	Q99928	467 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FEZF1	A0PJY2	475 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDF9	O60383	454 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF737	O75373	536 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN18	P56856	261 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CKS1B	P61024	79 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ICAM4	Q14773	271 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	STPG4	Q8N801	248 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMX1A	Q8TE12	382 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCAMP4	Q969E2	229 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSSCA1	O60232	199 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GOSR1	O95249	250 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF735	P0CB33	412 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLE1	Q04724	770 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RUNX2	Q13950	521 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GGTLC2	Q14390	218 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NINJ1	Q92982	152 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTX4	Q96A99	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM157A	C9JC47	383 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EQM0	130 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CST7	O76096	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYL1	P12980	280 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	AADAC	P22760	399 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIGP	P57054	158 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	UEVLD	Q8IX04	471 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL17F	Q96PD4	163 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7N7A8	449 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMPRSS11D	O60235	418 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf105	O95561	183 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACR	P10323	421 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF117	Q03924	483 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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