RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 AHSA2Q719I0 299 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 RNF144BQ7Z419 303 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SGCDQ92629 289 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SPSB1Q96BD6 273 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 UPRTQ96BW1 309 aa7.25□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 ZNF488Q96MN9 340 aa7.25□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.25□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 CDK1P06493 297 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SLC35A2P78381 396 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 BORCS8Q96FH0 119 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 IGKV1D-12P01611 117 aa7.23□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 NANPQ8TBE9 248 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 GPR148Q8TDV2 347 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 ST8SIA4Q92187 359 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SLAMF9Q96A28 289 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 MED30Q96HR3 178 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 CEP19Q96LK0 163 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 OPALINQ96PE5 141 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 TBX15Q96SF7 602 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.23□□□□□ -1.25
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