RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 HSMCR30P0CW71 290 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 IL13RA1P78552 427 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CD276Q5ZPR3 534 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CD177Q8N6Q3 437 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 OR51A2Q8NGJ7 313 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5D14Q8NGL3 314 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ORAI1Q96D31 301 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP19Q96LK0 163 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TAS2R4Q9NYW5 299 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 METRNQ9UJH8 293 aa21.94■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNRF1Q8ND25 227 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5D18Q8NGL1 313 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM106AQ96A25 262 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 MED30Q96HR3 178 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 MGLLQ99685 303 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNA2P01563 188 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 HCKP08631 526 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 NPBWR2P48146 333 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC10Q5BKY1 277 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 UBE2UQ5VVX9 321 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 NANPQ8TBE9 248 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 OR14J1Q9UGF5 321 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ANGPTL7O43827 346 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ALX3O95076 343 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CD2P06729 351 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 BCL3P20749 454 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 PDZK1IP1Q13113 114 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF529Q6P280 563 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TEX29Q8N6K0 151 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 SDSLQ96GA7 329 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 IL36RNQ9UBH0 155 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A087WXM4 84 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 IGKV1D-12P01611 117 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CD1AP06126 327 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 PRDX2P32119 198 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 FGF12P61328 243 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 YIF1BQ5BJH7 314 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ARMCX4Q5H9R4 360 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 LIPKQ5VXJ0 399 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 MKXQ8IYA7 352 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM185AQ8NFB2 350 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 UFD1Q92890 307 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 KNG1P01042 644 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CALCBP10092 127 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB3AP20336 220 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 EPHA1P21709 976 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 TPBGQ13641 420 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 KISS1Q15726 138 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 FCGR1BQ92637 280 aa21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
GTF3C4-202ENST00000483873 CYB5AP00167 134 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 SMIM18P0DKX4 95 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 CPEP16870 476 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFB7P17568 137 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ZP1P60852 638 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 NEDD8Q15843 81 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 Q499Y3 187 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 UPRTQ96BW1 309 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 OR14A2Q96R54 314 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 DCTN5Q9BTE1 182 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 NEK6Q9HC98 313 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 SFTPBP07988 381 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMB9P28065 219 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 CAV3P56539 151 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 C11orf91Q3C1V1 193 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 LY6G5BQ8NDX9 201 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52N4Q8NGI2 321 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 C22orf15Q8WYQ4 148 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PPK0 400 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF879B4DU55 563 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR37O15354 613 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 LIPFP07098 398 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPZA1P52907 286 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ARF6P62330 175 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR50Q13585 617 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 SSX1Q16384 188 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 PHC2Q8IXK0 858 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF561Q8N587 486 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 PCGF1Q9BSM1 259 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 TMED9Q9BVK6 235 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C4-202ENST00000483873 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms