RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470710.1

HDLBP-233, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-233ENST00000470710 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 COL12A1Q99715 3063 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 FAM221AA4D161 298 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 A6NLC8 198 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 F8VVB4 439 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 F8VWA3 439 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 H3BUI4 141 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 RHBDL1O75783 438 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MELTFP08582 738 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TNFRSF1AP19438 455 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 VEGFCP49767 419 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PPOXP50336 477 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MADCAM1Q13477 382 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ARL6IP1Q15041 203 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MPPED2Q15777 294 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PIGYQ3MUY2 71 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 AGAP6Q5VW22 663 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 C16orf87Q6PH81 154 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 WDR82Q6UXN9 313 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DTX2Q86UW9 622 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 Q8N402 240 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DTX3Q8N9I9 347 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 RAB3CQ96E17 227 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 NICN1Q9BSH3 213 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 HES4Q9HCC6 221 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1W2PPR1 153 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ISPDA4D126 451 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SERPINE3A8MV23 424 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SRRM5B3KS81 715 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 GABARAPH6UMI1 98 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 IFNL4K9M1U5 179 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SULT1C2O00338 296 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MFNGO00587 321 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SOCS1O15524 211 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CA11O75493 328 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 NXPH2O95156 264 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CSF3P09919 207 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DANCRP0C864 163 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PRKACAP17612 351 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CHATP28329 748 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PMELP40967 661 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TMEM50BP56557 158 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 DGCR2P98153 550 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TAF9Q16594 264 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 BAK1Q16611 211 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MPV17LQ2QL34 196 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CDNFQ49AH0 187 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SPRNQ5BIV9 151 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 HACD4Q5VWC8 232 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 OR8H2Q8N162 312 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CHST4Q8NCG5 386 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 TRIM63Q969Q1 353 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF488Q96MN9 340 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 IFT22Q9H7X7 185 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 GCM1Q9NP62 436 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 RASL12Q9NYN1 266 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 HSF4Q9ULV5 492 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1W2PQ09 198 aa7.34□□□□□ -1.23
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