RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 PAX5Q02548 391 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FUT5Q11128 374 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PEA15Q15121 130 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SAXO2Q658L1 398 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GLYATQ6IB77 296 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF148Q8N7C7 305 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10A6Q8NH74 314 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MRAPQ8TCY5 172 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NEURL3Q96EH8 262 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SMIM8Q96KF7 97 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RBP7Q96R05 134 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5B12Q96R08 314 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR7D2Q96RA2 312 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR52E6Q96RD3 313 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 WFDC1Q9HC57 220 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5H14A6NHG9 310 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 H0Y980 276 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 J3KTA2 159 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 M0QXV9 152 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB27BO00194 218 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DLGAP1O14490 977 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 XRCC2O43543 280 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UTS2O95399 124 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MT-ND4LP03901 98 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HPNP05981 417 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF44P15621 663 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ACHEP22303 614 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CDKN1AP38936 164 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ASCL1P50553 236 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 BIDP55957 195 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC61GP60059 68 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ERVFC1-1P60608 527 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DCST2Q5T1A1 773 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DRAM2Q6UX65 266 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 APOOLQ6UXV4 268 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 COX18Q8N8Q8 333 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 THAP6Q8TBB0 222 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ROPN1LQ96C74 230 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RCN3Q96D15 328 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MALSU1Q96EH3 234 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GNRHR2Q96P88 292 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GINS4Q9BRT9 223 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR76Q9H967 626 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB18Q9NP72 206 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PRR13Q9NZ81 148 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PP18 115 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PQD3 144 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX22C9J3V5 150 aa6.34□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MYL12BO14950 172 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms