RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 GCGP01275 180 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CFC1BP0CG36 223 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CFC1P0CG37 223 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RAB3BP20337 219 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ADORA2BP29275 332 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 GCLMP48507 274 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RORCP51449 518 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 STC1P52823 247 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 WNT4P56705 351 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RAB25P57735 213 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 DNAJB13P59910 316 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 KRTAP10-9P60411 292 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RHOAP61586 193 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ZNF92Q03936 586 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CD164Q04900 197 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 AESQ08117 197 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ECH1Q13011 328 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ZNF146Q15072 292 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SPA17Q15506 151 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 PRSS8Q16651 343 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 PARP15Q460N3 678 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 AVPI1Q5T686 147 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SAXO2Q658L1 398 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SSX7Q7RTT5 188 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RAB43Q86YS6 212 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 TERB2Q8NHR7 220 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CD200R1Q8TD46 325 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 APH1BQ8WW43 257 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 GPR22Q99680 433 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 APOL4Q9BPW4 351 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CLMPQ9H6B4 373 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RDH14Q9HBH5 336 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RARRES3Q9UL19 164 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CEP152O94986 1710 aa3.55□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 A0A087WXM4 84 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 A0A087X002 238 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 LYRM9A8MSI8 78 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 DISC1C4P0D8 188 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 FAM72CH0Y354 149 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 H3BSA7 217 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 H7C1H1 209 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 J3QRK9 145 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 M0R143 59 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CXCR6O00574 342 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 COPEO14579 308 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 MRASO14807 208 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 UBDO15205 165 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RAD51CO43502 376 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 KLRC4O43908 158 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 GADD45GO95257 159 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 TTC4O95801 387 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 LALBAP00709 142 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ARG1P05089 322 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 HTR1AP08908 422 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR10J4P0C629 311 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 OR8U8P0C7N1 319 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 PATE4P0C8F1 98 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CT45A10P0DMU9 189 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 FOLR2P14207 255 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 GABRA1P14867 456 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 IGLL1P15814 213 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 ANOS1P23352 680 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CHRNB4P30926 498 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 CD200P41217 278 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 KIR2DS2P43631 304 aa3.54□□□□□ -1.84
ATRX-204ENST00000460639 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms