RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 REC114Q7Z4M0 266 aa9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-210ENST00000442481 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-210ENST00000442481 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-210ENST00000442481 YIPF6Q96EC8 236 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ABCB9Q9NP78 766 aa9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-210ENST00000442481 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 CCDC160A6NGH7 325 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 TMEM210A6NLX4 147 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ZNF732B4DXR9 585 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 SYT7O43581 403 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 GPR137BO60478 399 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 FDX2Q6P4F2 183 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 ZFPL1O95159 310 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-69P01742 117 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 CSF1P09603 554 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 PROK1P58294 105 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 GNG3P63215 75 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 MICBQ29980 383 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 WDR82Q6UXN9 313 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 GHSRQ92847 366 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 WDFY2Q96P53 400 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 OR51E2Q9H255 320 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 BATF3Q9NR55 127 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 TMEM212A6NML5 194 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 AKR7A2O43488 359 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-1P01715 115 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 FBP1P09467 338 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 GABRA5P31644 462 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 IER3P46695 156 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 CCR9P51686 369 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-3P60369 221 aa9.62□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 C11orf88Q6PI97 169 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 C1QL4Q86Z23 238 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 RDH10Q8IZV5 341 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 BATF2Q8N1L9 274 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 DTX3Q8N9I9 347 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ST8SIA4Q92187 359 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 SEH1LQ96EE3 360 aa9.62□□□□□ -0.87
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