RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CENPMQ9NSP4 180 aa6.54□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NDE1Q9NXR1 346 aa6.54□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.54□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR5B21A6NL26 309 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBDO15205 165 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TPPPO94811 219 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CASQ1P31415 396 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAB9AP51151 201 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TNFRSF9Q07011 255 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KLHL12Q53G59 568 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FGD3Q5JSP0 725 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RRM2BQ7LG56 351 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCF23Q7RTU1 214 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR8H2Q8N162 312 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNX22Q96L94 193 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SORT1Q99523 831 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KLK15Q9H2R5 256 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PNPOQ9NVS9 261 aa6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 A0A0J9YWU9 116 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM183AA6NL82 134 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF878C9JN71 531 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDC42EP2O14613 210 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BIRC5O15392 142 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF737O75373 536 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MMP23AO75900 390 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RGS11O94810 467 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGKV1D-33P01593 117 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGKV1-33P01594 117 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SHBGP04278 402 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PEX2P28328 305 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GLIPR1P48060 266 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CX3CR1P49238 355 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAB7AP51149 207 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EBI3Q14213 229 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EDDM3AQ14507 147 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRAM2Q15035 370 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LCN12Q6JVE5 192 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM57BQ71RH2 274 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF575Q86XF7 245 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR8H3Q8N146 312 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITFG2Q969R8 447 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRRC1Q96M27 445 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.52□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XRCC3O43542 346 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IFNA14P01570 189 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TNFRSF1BP20333 461 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDK2P24941 298 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ACKR3P25106 362 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSD11B1P28845 292 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SOX6P35712 828 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF45Q02386 682 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STX3Q13277 289 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GALEQ14376 348 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF573Q86YE8 665 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 Q8N402 240 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 Q8N9W7 124 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR9G1Q8NH87 305 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PGAM5Q96HS1 289 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF488Q96MN9 340 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NMNAT3Q96T66 252 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.51□□□□□ -1.37
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms